Příkazy GeoGebra skriptu zadáváme jako metodu ggbApplet, např: ggbApplet.setVisible('p',true). Seznam všech podporovaných příkazů zde: Geogebra API.
Nefunguje to se soubory, kde je něco naprogramováno, nebo kde je posloupnost.
Algebraické zůstane zobrazeno, pokud je otevřenné v ggb souboru.
Použijte příkazový řádek k zápisu jakéhokoliv příkazu, např. B = (0,0,1) pro změnu polohu bodu B, který zadává rovinu řezu.